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衛生署為保障全民食用健康食品之安全性, 96 年規劃建置全國民眾食用健康食品後產生非預期反應之通報系統,以提供衛生署管理健康食品之政策參考。同年 10 月底衛生署委託財團法人藥害救濟基金會進行「建置全國健康食品非預期反應通報系統」之籌劃工作,兩個月期間蒐集國外相關資訊,提供作為建置國內健康食品非預期反應通報系統之參考。 97 年 3 月衛生署繼續委託財團法人藥害救濟基金會執行「全國健康食品非預期反應通報系統」計畫,包括通報系統網頁架設、制定通報表格與作業流程及宣導工作。
本系統原以核定之健康食品為主,但為廣泛收納通報範圍,亦涵蓋錠膠劑型之ㄧ般食品, 98 年修正為「全國健康食品及膠囊錠狀食品非預期反應通報系統」。旨在促進我國民眾使用衛生署核定之「健康食品」及錠膠劑型之食品的安全性,藉由健康 食品及膠囊錠狀食品非預期反應通報系統 之運作,使醫事人員、廠商、民眾、經銷商、消保團體、消費通路等發現「健康食品」及膠囊錠狀之保健食品的非預期反應時可即時通報。由通報個案之收集、分析及彙整,建立「保健食品」安全疑慮評估研究之機制,期能發現「保健食品」潛在可能引發公眾健康危害之非預期反應,提供主管單位政策參考。欲藉此建立本土之「保健食品」安全資料庫、通報資料評估及資訊回饋制度;並教育醫事人員、廠商、民眾、經銷商、消保團體、消費通路等,加強其對食用「保健食品」引起之非預期反應的認識與防患,提昇保健食品使用之安全性,以維護民眾之健康福祉。